NCTC 3000 strains: M-O
| NCTC Number | Current name | Whole genome sequence | Annotated sequence |
| 9380 | Mannheimia haemolytica | ERS1068201 | ERS1068201 |
| 10609 | Mannheimia haemolytica | ERS715408 | ERS715408 |
| 10638 | Mannheimia haemolytica | ERS569361 | ERS569361 |
| 10570 | Megamonas hypermegale | ERS1275669 | |
| 2665 | Micrococcus luteus | ERS1054576 | ERS1054576 |
| 11037 | Micrococcus lylae | ERS1497479 | |
| 11656 | Mobiluncus curtisii subsp. curtisii | ERS1234141 | |
| 11657 | Mobiluncus curtisii subsp. holmesii | ERS1324128 | |
| 11658 | Mobiluncus mulieris | ERS1345972 | |
| 12132 | Moellerella wisconsensis | ERS462981 | ERS462981 |
| 11020 | Moraxella (branhamella) catarrhalis | ERS1247838 | |
| 10293 | Moraxella (branhamella) caviae | ERS1353908 | |
| 10297 | Moraxella (branhamella) cuniculi | ERS1211135 | |
| 11227 | Moraxella (branhamella) ovis | ERS1247844 | |
| 11091 | Moraxella atlantae | ERS1234130 | |
| 12925 | Moraxella boevrei | ERS1497502 | |
| 11012 | Moraxella equi | ERS1234129 | |
| 7911 | Moraxella lacunata | ERS1211132 | |
| 10465 | Moraxella osloensis | ERS1295515 | |
| 235 | Morganella morganii | ERS513125 | ERS513125 |
| 12028 | Morganella morganii | ERS530427 | ERS530427 |
| 13031 | Mycobacterium abscessus | ERS1188814 | |
| 10820 | Mycobacterium aichiense | ERS1247823 | |
| 10437 | Mycobacterium aurum | ERS1275659 | |
| 946 | Mycobacterium chelonae subsp.chelonae | ERS1211133 | |
| 10485 | Mycobacterium chitae | ERS1275660 | |
| 10271 | Mycobacterium flavescens | ERS1247813 | |
| 10942 | Mycobacterium gadium | ERS1345968 | |
| 10742 | Mycobacterium gilvum | ERS1247812 | |
| 9822 | Mycobacterium gordonae | ERS1324104 | |
| 2275 | Mycobacterium marinum | ERS1275654 | |
| 10424 | Mycobacterium nonchromogenicum | ERS1345966 | |
| 10264 | Mycobacterium peregrinum | ERS1497473 | |
| 8151 | Mycobacterium phlei | ERS1211594 | |
| 10779 | Mycobacterium rhodesiae | ERS1247810 | |
| 8159 | Mycobacterium smegmatis | ERS451418 | ERS451418 |
| 10856 | Mycobacterium terrae | ERS1345967 | |
| 10409 | Mycobacterium thermoresistibile | ERS1324105 | |
| 10916 | Mycobacterium vaccae | ERS1497476 | |
| 10135 | Mycoplasma alkalescens | ERS1345977 | |
| 10122 | Mycoplasma bovigenitalium | ERS1345973 | |
| 10118 | Mycoplasma bovirhinis | ERS1324145 | |
| 10147 | Mycoplasma conjunctivae | ERS1324147 | |
| 10142 | Mycoplasma cynos | ERS1324146 | |
| 10125 | Mycoplasma dispar | ERS1345974 | |
| 10117 | Mycoplasma fermentans | ERS1324144 | |
| 10183 | Mycoplasma gallinaceum | ERS1324150 | |
| 10115 | Mycoplasma gallisepticum | ERS1295691 | |
| 10121 | Mycoplasma hyorhinis | ERS1295524 | |
| 10130 | Mycoplasma hyorhinis | ERS1295692 | |
| 10166 | Mycoplasma neurolyticum | ERS1324149 | |
| 10112 | Mycoplasma orale | ERS1295522 | |
| 10119 | Mycoplasma pneumoniae | ERS1295756 | |
| 10155 | Mycoplasma putrefaciens | ERS1324148 | |
| 10113 | Mycoplasma salivarium | ERS1324143 | |
| 10124 | Mycoplasma synoviae | ERS986343 | ERS986343 |
| 11180 | Myroides odoratimimus | ERS1234140 | |
| 11036 | Myroides odoratus | ERS1275670 | |
| 10212 | Neisseria animalis | ERS950465 | ERS950465 |
| 10296 | Neisseria canis | ERS1058919 | ERS1058919 |
| 10294 | Neisseria cinerea | ERS1022038 | ERS1022038 |
| 10660 | Neisseria elongata | ERS980032 | ERS980032 |
| 11050 | Neisseria elongata subsp. glycolytica | ERS1509219 | |
| 8263 | Neisseria flavescens | ERS1123926 | |
| 10928 | Neisseria gonorrhoeae | ERS627820 | ERS627820 |
| 10931 | Neisseria gonorrhoeae | ERS627821 | ERS627821 |
| 12700 | Neisseria gonorrhoeae | ERS627822 | ERS627822 |
| 13482 | Neisseria gonorrhoeae | ERS1106937 | ERS1106937 |
| 13483 | Neisseria gonorrhoeae | ERS904746 | |
| 13484 | Neisseria gonorrhoeae | ERS1275672 | |
| 13795 | Neisseria gonorrhoeae | ERS1247847 | |
| 13798 | Neisseria gonorrhoeae | ERS1247851 | |
| 13799 | Neisseria gonorrhoeae | ERS1247875 | |
| 13800 | Neisseria gonorrhoeae | ERS1247878 | |
| 13801 | Neisseria gonorrhoeae | ERS1247879 | |
| 13802 | Neisseria gonorrhoeae | ERS1247880 | |
| 13803 | Neisseria gonorrhoeae | ERS1247881 | |
| 13804 | Neisseria gonorrhoeae | ERS1247882 | |
| 13805 | Neisseria gonorrhoeae | ERS1247883 | |
| 13817 | Neisseria gonorrhoeae | ERS1497492 | |
| 13819 | Neisseria gonorrhoeae | ERS1497493 | |
| 13822 | Neisseria gonorrhoeae | ERS1497494 | |
| 10617 | Neisseria lactamica | ERS1054582 | ERS1054582 |
| 10618 | Neisseria lactamica | ERS627819 | ERS627819 |
| 13585 | Neisseria weaveri | ERS627823 | ERS627823 |
| 11293 | Nocardia asteroides | ERS1497486 | |
| 11294 | Nocardia brasiliensis | ERS1247828 | |
| 11134 | Nocardia farcinica | ERS450000 | ERS450000 |
| 12168 | Ochrobactrum anthropi | ERS617396 | ERS617396 |
| 12171 | Ochrobactrum intermedium | ERS617397 | ERS617397 |
| 11973 | Oerskovia turbata | ERS1275651 |
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